Bueno... lo mío es la animación, no Derecho. Yo creo que si es, como dices, un corto sin ánimo de lucro no tiene por qué pasar nada si le pones música comercial. He visto muchas showreels con música de Linkin Park o de otros grupos.
Si hiceras algo de más difusión, habría que comprar los derechos de autor de la banda sonora, pero repito, eso es sólo lo que yo creo.