Pues creo que es problema de Zbrush3.
A mi me pasa al contrario, los objetos importados en Zbrush 3 desde XSI me salen invertidos. En la preferencias de Zbrush he activado ImportExport > Flip X. y solucionado (tanto para exportar como para importar)
No se porque ocurre esto, en la versión 2 no pasaba....
Lo que no se, es como hacer para que estas preferencias queden fijas, porque tengo que hacerlo con cada sesión....