Me parece un poco raro que la bios deje de ver un disco por una modificación a nivel de s.o.
Por lo que has ido comentando, apunta a alguna causa del tipo fallo del firmware/controladora del disco, o incluso a nivel fisico, algún capacitador petado (aunque esto se da por una sobretensión eléctrica).
¿qué características tiene ese disco? es HDD o SSD? IDE, SATA, SCSI, SAS...? ¿Si el disco es HDD, se le oye moverse al dar corriente electrica? Pensando en una posible falta de tensión, debido a fuente de alimentación.