La posición ahora parece haberse quedado en su sitio, pero de todos modos no me fio, mañana lo volveré abrir y lo mismo vuelve a hacer el cabra con las posiciones.
En cuanto a la tonteria de petarme al cargar uno de los ref.models, después de borrar ese .emdl, he buscado a ver de dónde provenía el problema probando a exportar con otra geometría dentro del modelo, y he llegado a determinar que fallaba el model, o sea he tenido que borrar el null que hace de model, y volver a crear otro.
Eso si, no tengo ni idea de qué problema había en ese model. Ya es más que una sensación que este software corrompe datos, acumula errores que vayan produciendose o yo que sé...o a lo mejor es mi ram, que no está certificada por Softimage, y pierde bloques aleatoriamente.