Hombre, la verdad es que el tema es jodido, pero yo procuraría averiguar (más o menos) cuanto dinero se va a ahorrar la empresa gracias a tu trabajo y echar números en consecuencia, procurando que les salga más rentable pagarte a ti que hacerlo todo de nuevo.
También procuraría saber cuan necesario es para la empresa. Si ven que se pueden apañar sin ello, pagarán menos. Si les es imprescindible, pagarán más.
Por otro lado, sólo tú sabes en cuanto valoras tu trabajo (es, en cierto modo, como el pintor que vende un cuadro).
Además, hay otros factores, como que si (quizá) bajas un poco el precio, te den más trabajos, pero quizá no quieras trabajar más con ellos y te interese sacarles cuanto puedas, etc...
Es lo que yo haría, que no es ni lo único ni puede que lo mejor.