Eso ocurre por el modo d añadir resolución q tiene XSI.
Fíjate q tiene un orden lógico, no subdivide la malla sino q desplaza los edges por la superficie desde un punto d inicio hasta el final de esta.
Al hacer esto los polígonos, lógicamente, se disgregan por la superficie y XSI, para evitar errores, pierde los clusters, puesto q no sabe si quieres q esos polígonos sigan siendo un cluster aun q estén en otra posición o por el contrario quieres q se mantenga el cluster en el mismo sitio pero con otros polígonos. Quien dice polígonos dice tags o edges. Tanto monta, monta tanto.
Yo lo hago a mano, es rápido, ágil y sencillo.
Aun q lo puedes 'congelar' como dice Eduardito.
Saludos