Si te he entendido bien: en el texture editor, todo lo que esta fuera de la proyeccióm (osea el cuadrado que delimita el espacio de la textura)..no esta incluido en ella, por lo que no se texturiza.
En el Texture Editor, selecciona los puntos y modifica la posición, tamaño o rotación de essa partes que estan fuera de latextura con las diferentes herramientas del tetxure editor para situar y encajarlos con la textura.
No se porque te ha pasado, normalmente al crear una proyección esta incluye toda la geometría.
Ahora bien, si has añadido poligonos a una proyección existente, es normal que te pase.
No se si me he explicado bien,....espero que te sirva.
Salu2