Cuando tengas la animación terminada y lista (o aprobada, que no siempre ha de ser lo mismo... ) guardas las curvas para el Animation Mixter y le das a la pestaña de borrar la animación original.
Y si seleccionas el controlador, manejador, hueso directamente, o lo que sea que animes y le das a 2-animation-plot ya estará ploteado. No te hace falta pasarlo al mixer. Te pide frame inicial, frame final e intervalo de ploteo, si quieres claves cada x frames.
Recuerda que antes de eliminar el constrain de un objeto a otro debes de plotear primero el objeto que tiene el constrain y luego ya te preguntará directamente si quieres eliminar ese constrain. Y después ya puedes plotear el objeto que "mandaba" sobre el otro.
Pero esto de plotear es para controles y huesos de xsi, no para los puntos de la geometria, que es en realidad lo que sucede cuando se utiliza una herramienta de bake, o como sea que se diga a ese proceso