Definitivamente es odioso que los nodos salgan donde quieren, además de que muchas veces salen alrevés, por ejemplo el nodo de mapa de textura delante del nodo image.
Lo de ctrl+r está bien, pero tampoco sirve para todos los casos, porque te reorganiza los nodos que no tengas conectados y te los pone abajo, cosa que no es práctica cuando estás haciendo pruebas.
En definitiva, es una cagada que arrastramos desde la versión 7 que antes no pasaba.
Yo no paro de encontrarme bugs tontos que antes no ocurrían, no se si es la mano de Autodesk o qué, pero parece que vamos para atrás en vez de para alante.