Tal y como yo lo veo, si vas a empezar el proceso en Zbrush y lo vas a terminar ahí sin salir a otro soft, las proyecciones que hace ZBrush son lo bastante apañadas como para no tener que preocuparte de ellas (eso sí, sólo las entiende el programa).
Si tienes intención de saltar de un software a otro alegremente, ten mucho cuidado, porque ZBrush trabaja con una burrada de polígonos, que para luego hacer las UVs te vas a ver negro (umm, mala expresión cuando uno no ve con quien esta hablando o quien puede leer esto). En cualquier caso, el sistema que yo conozco más es hacer un modelado low pol en cualquier software, darle UVs y pasarlo a ZBrush, porque, además, si no me equivoco, no se puede mapear un objeto en Zbrush (más bien, yo no sé como).