Estaba funcionando con raysat3_4_6_18 bajo XSI 5.11 en todos los nodos. Simplemente he instalado el satelite del XSI 6.01 (raysat3_5_7_15) en dos nodos para testear la versión 6 antes de migrar definitivamente.
He detenido el anterior raysat en ambos nodos e iniciado el nuevo raysat. Además los he configurado en escuchando diferente puerto. He revisado windows/system32/drivers/etc/services y parece estar todo correcto.
De no ser que hayan cambiado algo que deba documentarme de nuevo, no sé que pasa.