Unaided_xsi, sí que los deforma aunque no se vean, haz la prueba...
César, simplemente pensaba que habría algun tipo de enmascaramiento parecido al que tiene ZBrush por ejemplo. He visto otra solución que consiste en seleccionar todos los puntos que quiero modificar y usar, no el tweak tool, sino el Move Point Tool junto con la opción "Tagged points only" de las propiedades del Proportional Modeling, pero es también un poco engorroso...
Gracias por vuestra ayuda.