Yo hace años tuve un problema.
Pentium III, con 2 HD y un cd, le instalé ademas una grabadora de cd.
La fuente de alimentación no pudo con todo y la lió, se me jodió 1 HD (todavía recuerdo el humo saliendo de un chip)
Me compré uno exactamente igual, desconectas la controladora (parte electronica) del disco (almacén) a ambos discos. Puse la controladora nueva con el disco antiguo y voilá, disco nuevo.
Imagino que a ti te habrá pasado algo parecido, se jode la controladora, no los datos.