Vale!!! ahora entiendo porque no te va!! es que en bodypaint estas configurando unas UVs distintas!!
Por eso no encajan en las UVs que tenias en XSI.
Lo que tienes que hacer despues de abrir el obj en BP3D es pinchar sobre el material del objeto. Cuando lo tengas seleccionado, le das a "textura" --> "canales de textura" y despues al canal que quieras pintar (color, por ejemplo) entonces ya puedes pintar sobre el modelo!!