No, no he hecho nada "raro".
Bueno, pues resulta que algunas escenas las abrí con la 6 y otras con la 6.0.1, y creo que se ha creado alguna incompabilidad o algo.
He creado un nuevo proyecto con la 6.0.1 y he abiero la escena de otro proyecto y la he guardado copiando todos los archivos necesarios y parece que se ha solucionado.
No es bueno tener ambas versiones juntas, creo que no van muy finas si mezclas escenas de una y de otra.
Creo yo que ha sido eso, por que otra cosa.
No me daba ningun error de incompatibilidad ni nada, sólo se cerraba y punto.
Gracias a los dos.